Iori Kitahara chuyển đến thị trấn ven biển Izu để học năm thứ nhất tại trường đại học của mình, cư trú trên Grand Blue, cửa hàng lặn biển của chú anh. Iori có nhiều hy vọng và ước mơ về trải nghiệm học đại học lý tưởng, nhưng khi bước vào cửa hàng, anh bị cuốn vào các hoạt động say xỉn của các thành viên vô tư của Câu lạc bộ Lặn thường xuyên lui tới. Được các học sinh lớp trên Shinji Tokita và Ryuujirou Kotobuki thuyết phục, Iori miễn cưỡng tham gia bữa tiệc kỳ lạ của họ. Em họ của anh ta, Chisa Kotegawa sau đó bước vào và bắt quả tang anh ta đang hành động, khiến Iori vô cùng khinh bỉ.
Dựa trên bộ truyện tranh hài nổi tiếng của Kenji Inoue và Kimitake Yoshioka, Grand Blue kể về những sai lầm của Iori với những người bạn mới lập dị của mình khi anh ấy cố gắng thực hiện ước mơ đại học lý tưởng của mình, đồng thời học cách lặn biển.