Eruna Ichinomiya mong muốn được ở bên những cô gái xinh xắn mặc những bộ quần áo dễ thương. Vì trường trung học Mikagura tình cờ có những bộ đồng phục dễ thương nhất xung quanh, cô quyết định đăng ký vào trường trung học danh tiếng nổi tiếng với các câu lạc bộ văn hóa này.
Tuy nhiên, cô ấy không nhận ra rằng việc gia nhập một câu lạc bộ là bắt buộc, và các đại diện từ mỗi câu lạc bộ phải đấu tranh để xếp hạng. Dựa trên các bảng xếp hạng này, các thành viên câu lạc bộ được trao nhà ở và thực phẩm. Đuổi theo Seisa Mikagura, cô gái xinh đẹp nhất trường, Eruna gia nhập câu lạc bộ về nhà nhưng thấy mình phải lao vào trận chiến câu lạc bộ tiếp theo. Với các đại diện câu lạc bộ khác sở hữu sức mạnh độc nhất vô nhị, cuộc cạnh tranh chắc chắn sẽ rất khốc liệt!
Dựa trên loạt bài hát nổi tiếng, Mikagura Gakuen Kumikyoku theo chân Eruna khi cô khám phá các câu lạc bộ khác nhau trong trường và hỗ trợ các thành viên trong cuộc sống khó khăn của họ, tất cả đều đang cạnh tranh cho vị trí đầu bảng trong trường.