Trong một vũ trụ quen thuộc nhưng khác lạ, chàng mọt sách và game thủ nhút nhát Yuki Nagato là chủ tịch Câu lạc bộ Văn học của trường Trung học North. Bạn bè của cô, Ryouko Asakura quá thận trọng và Kyon hoàn toàn bình thường, là những thành viên duy nhất khác của câu lạc bộ. Tuy nhiên, Yuki thích sự yên bình và tĩnh lặng mà cô ấy chia sẻ với họ, đặc biệt là khi cô ấy ở bên Kyon, người mà cô ấy phải lòng. Thêm vào hỗn hợp là Tsuruya và Mikuru Asahina, hai người bạn có tính cách trái ngược nhau thường xuyên ghé qua Câu lạc bộ Văn học.
Khi đang trở về căn hộ của mình vào một ngày tháng 12 lạnh giá, Yuki bị ép buộc vẽ những biểu tượng kỳ lạ trên mặt đất bởi một cô gái được cho là đang cố bắt ông già Noel. Cô gái tự giới thiệu mình là Haruhi Suzumiya, một học sinh lập dị đến từ Học viện Kouyouen danh tiếng, người đang săn lùng người ngoài hành tinh, du hành thời gian và siêu năng lực gia. Khi Haruhi và người bạn Itsuki Koizumi đột ngột xuất hiện trong phòng câu lạc bộ, họ tuyên bố mình là thành viên chính thức của Câu lạc bộ Văn học, Haruhi đảm nhận vị trí chủ tịch điều hành.
Với những ngày yên bình của Câu lạc bộ Văn học giờ đã ở sau lưng họ, Yuki và những người bạn của cô ấy bị cuốn vào một loạt các hành vi sai trái dưới sự lãnh đạo của Haruhi — với mỗi sự cố lại đưa Yuki và Kyon đến gần nhau hơn bao giờ hết.