Hana, một sinh viên đại học chăm chỉ, đem lòng yêu một người đàn ông bí ẩn học cùng lớp với cô mặc dù anh ta không phải là sinh viên thực sự. Hóa ra, anh ta cũng không thực sự là con người. Vào một đêm trăng tròn, anh ta biến hình, tiết lộ rằng anh ta là người sói cuối cùng còn sống. Mặc dù vậy, tình yêu của Hana vẫn bền chặt và cuối cùng cả hai quyết định lập gia đình.
Hana sinh ra hai đứa con khỏe mạnh Ame, sinh ra khi trời mưa và Yuki, sinh ra khi tuyết rơi cả hai đều sở hữu khả năng biến thành sói, một đặc điểm thừa hưởng từ cha của họ. Tuy nhiên, quá sớm, cái chết đột ngột của người yêu đã tàn phá cuộc sống của Hana, khiến cô phải tự mình nuôi nấng một gia đình đặc biệt. Sự căng thẳng khi nuôi dạy những đứa con hoang dã của cô trong một thành phố đông dân cư, trong khi vẫn giữ bí mật về danh tính của chúng, lên đến đỉnh điểm là quyết định chuyển đến vùng nông thôn, nơi cô hy vọng Ame và Yuki có thể sống một cuộc sống không bị xã hội phán xét. Wolf Children là câu chuyện cảm động về những thử thách khi làm mẹ đơn thân trong một thế giới hiện đại không khoan nhượng.