Sau một cuộc chiến tranh giữa các hành tinh vào đầu thế kỷ 21, hành tinh Trái đất đã bị bỏ lại trong đống đổ nát, với phần lớn hệ sinh thái của nó bị phá hủy hoàn toàn. Bởi vì không còn có thể sống một cuộc sống bình thường trên hành tinh này, các cư dân buộc phải di chuyển đến các hành tinh khác, nơi cuộc sống hy vọng sẽ thoải mái hơn.
Tổ chức Thương mại Deep Galactic, một chính phủ độc tài có ảnh hưởng đến nhiều hành tinh mới có người sinh sống, bằng cách nào đó đã đi đến kết luận rằng âm nhạc là nguồn gốc của cái ác, và nó phải bị cấm và tiêu diệt vì điều tốt đẹp. Nhóm nhạc tài năng AKB0048 sớm được thành lập, dựa trên các thành viên ban đầu của AKB48 từng sống trên Trái đất. Mặc dù âm nhạc của họ hiện bị coi là bất hợp pháp trên toàn cầu, nhưng họ vẫn thực hiện sứ mệnh mang âm nhạc của mình trở lại cuộc sống bằng cách du hành từ hành tinh này sang hành tinh khác và tổ chức nhiều buổi hòa nhạc nhất có thể. Họ phải trải qua một loạt các phương pháp đào tạo hoàn toàn mới để trở thành người giỏi nhất có thể, đồng thời tránh nguy cơ bị bắt giữ liên tục vì âm nhạc của họ. Tham gia nhóm nhạc pop liên hành tinh AKB0048 khi họ cố gắng cứu thế giới - bằng âm nhạc!