Sau khi giành chiến thắng từ một giải đấu ngầm tàn khốc, Baki Hanma tiếp tục con đường đánh bại cha mình, Yuujirou, người đàn ông mạnh nhất thế giới. Tuy nhiên, anh ấy không có thời gian để nghỉ ngơi khi vận động viên của giải đấu, Tokugawa Mitsunari, đến thăm anh ấy ở trường. Anh ta tiết lộ với Baki rằng năm tử tù cực kỳ nguy hiểm từ khắp nơi trên thế giới tất cả đều tinh thông võ thuật đã đồng thời trốn thoát khỏi nơi giam giữ và đang hướng đến Tokyo, mỗi người đều mong muốn cuối cùng được nếm mùi thất bại. Tokugawa cảnh báo rằng, do sức mạnh nổi tiếng của mình, Baki sớm muộn gì cũng sẽ chạm trán với họ, và anh ta sẽ không phải là mục tiêu duy nhất của họ.
Chuyển thể từ câu chuyện đầu tiên của bộ truyện tranh thứ hai, Baki tập trung vào cuộc chiến toàn diện giữa các võ sĩ đáng kính của Nhật Bản và những người thuộc thế giới ngầm đen tối.