Edward Elric, một nhà giả kim trẻ tuổi, tài giỏi, đã mất nhiều thứ trong cuộc đời mười hai năm của mình: khi anh và anh trai Alphonse cố gắng hồi sinh người mẹ đã khuất của họ thông qua hành động biến đổi người bị cấm, Edward mất đi anh trai cũng như hai chi của mình. . Với kỹ năng giả kim tuyệt đỉnh của mình, Edward đã trói linh hồn của Alphonse vào một bộ áo giáp lớn.
Một năm sau, Edward, lúc này đã được thăng cấp thành nhà giả kim đầy đủ của bang, bắt đầu một cuộc hành trình với em trai mình để lấy được Hòn đá phù thủy. Vật thể thần thoại được đồn đại là có khả năng khuếch đại khả năng của một nhà giả kim bằng những bước nhảy vọt, do đó cho phép họ vượt qua quy luật cơ bản của thuật giả kim: để đạt được thứ gì đó, một nhà giả kim phải hy sinh một thứ có giá trị tương đương. Edward hy vọng sẽ thu hút được nguồn lực của quân đội để tìm ra viên đá huyền thoại và khôi phục cơ thể của anh và Alphonse trở lại bình thường. Tuy nhiên, anh em nhà Elric sớm phát hiện ra rằng có nhiều điều hơn là nhìn thấy hòn đá huyền thoại, vì họ được dẫn đến tâm điểm của một trận chiến đen tối hơn nhiều so với những gì họ có thể tưởng tượng.