Trong lễ hội mùa hè năm năm trước, hai cô gái gặp nhau tại một cái cây bí ẩn và nhìn thấy hai quả cầu phát sáng. Bây giờ, hai cô gái này - Saki Hyuuga, ace ném bóng trong đội bóng mềm của trường; và Mai Mishou, người thích phác thảo hơn là ngắm sao - được chọn bởi các linh hồn của hoa (Flappy) và chim (Choppy) để khôi phục Bảy Đài phun nước và cứu thế giới của họ khỏi Dark Autumn. Cùng với nhau, họ là những Pretty Cure MỚI.