Có tồn tại những sinh vật bóng tối và ác quỷ hoành hành trong đêm, nuốt chửng bất kỳ con người nào không may bị chúng tóm gọn. Ở phía bên kia là Hellsing, một tổ chức chuyên tiêu diệt những thế lực siêu nhiên đang đe dọa sự tồn tại của loài người. Đứng đầu là Integra Fairbrook Wingates Hellsing, người chỉ huy một đội quân hùng mạnh và dành cả cuộc đời để chiến đấu với xác sống.
Tuy nhiên, đội quân đông đảo của Integra lại mờ nhạt so với vũ khí tối thượng của cô: ma cà rồng Alucard, kẻ chống lại chính đồng loại của mình với tư cách là kẻ hủy diệt cho Hellsing. Với người hầu ma cà rồng mới của mình, Seras Victoria, ở bên cạnh, Alucard không chỉ phải chiến đấu với quái vật mà còn phải chiến đấu với tất cả những kẻ chống lại Hellsing, dù họ đội lốt thiện hay ác.
Trong cuộc chiến vì sự sống còn của nhân loại, Hellsing Ultimate chứng minh rằng vẻ bề ngoài không phải là tất cả những gì chúng có vẻ như, và đôi khi vũ khí vĩ đại nhất có thể xuất hiện dưới dạng cơn ác mộng tồi tệ nhất của một người.