Sau nhiều khó khăn trong cuộc sống, Chise Hatori cuối cùng đã tham gia một cuộc đấu giá, nơi cô được mua và sau đó được trả tự do bởi Phù thủy Thorn nổi tiếng, Elias Ainsworth, chỉ để ở lại và trở thành người học việc của ông. Mặc dù cuộc sống của cô ấy bây giờ thật tuyệt vời, nhưng sự xuất hiện của cuốn sách ảnh "Ngôi sao nhỏ cô đơn" gợi lại những ký ức về khoảng thời gian khó khăn và sự cô đơn mà cô ấy phải chịu đựng.
Khi còn nhỏ, Chise đã trải qua một bi kịch lớn: cái chết của mẹ cô. Bị đồng nghiệp và người thân xa lánh và không mong muốn, cô đã sống một cuộc sống tách biệt và đáng thương. Tuy nhiên, việc bất ngờ phát hiện ra một thư viện bí ẩn trong rừng đã mang đến cho cô một nơi an ủi tạm thời. Thông qua việc đọc vô số sách và dành thời gian với người thủ thư tốt bụng, Chise dần bắt đầu cảm thấy bớt cô đơn trên thế giới.