Sau sự kiện của Senki Zesshou Symphogear G, Hibiki Tachibana, Tsubasa Kazanari và Chris Yukine tiếp tục hoạt động dưới sự chỉ huy của Genjuurou Kazanari. Trong khi đó, Maria Cadenzavna Eve, Kirika Akatsuki và Shirabe Tsukuyomi bị quản thúc bảo vệ. Hòa bình lập lại, mọi người đều trở lại cuộc sống thường ngày; tuy nhiên, sự xuất hiện của nhà giả kim Carol Malus Dienheim và thuộc hạ của cô - những "Kẻ đánh cắp tự động" - có nguy cơ lôi kéo mọi người trở lại cuộc xung đột.
Được trang bị một sức mạnh kỳ lạ và ma thuật, Carol mong muốn khơi mào cho ngày tận thế và mang đến sự hủy diệt cho thế giới ... và cô ấy sẵn sàng hy sinh tất cả để làm điều đó. Để chống lại kẻ thù mới bí ẩn này, sáu người sử dụng Symphogear phải vượt qua thử thách để bảo vệ những gì họ yêu quý. Tuy nhiên, liệu Carol và các Autoscorers của cô ấy có tỏ ra quá đáng để xử lý trong cuộc chiến này để bảo vệ số phận của thế giới?