Hồ sơ Thiên thể nói về sự tồn tại của "Seraphim", một chủng tộc gồm các vị thần ban phước lành cho nhân loại và được họ cầu nguyện để đáp lại. Những người được xức dầu có khả năng tương tác với những linh hồn này được gọi là "Người chăn cừu". Được ca ngợi như những anh hùng vì sự xuất hiện nhanh chóng của họ trong thời kỳ khủng hoảng, đồng thời bị sợ hãi vì sức mạnh của họ, những Người chăn cừu được ghi dấu ấn trong văn hóa dân gian chung cùng với các Seraphim.
Sorey là một chàng trai trẻ đã dành cả cuộc đời mình để sống hòa thuận với các Seraphim tại làng Elysia. Bị mê hoặc bởi những câu chuyện thần thoại về Hồ sơ Thiên thể, anh khám phá một số tàn tích gần đó với Mikleo - người bạn đồng hành Seraphim thời thơ ấu của anh - với hy vọng hiểu rõ hơn về lịch sử của các Seraphim với nhân loại.
Thật không may, họ bị mắc kẹt ở sâu trong di tích lịch sử trong quá trình điều tra. Trong khi tìm kiếm lối thoát, họ tình cờ gặp một cô gái bí ẩn đang tuyệt vọng tìm kiếm sự giúp đỡ của Shepherd để cứu thế giới đang trên bờ vực bị bóng tối nuốt chửng. Bất chấp lời cảnh báo của Mikleo về việc tiếp xúc với những người khác, Sorey quyết định giúp đỡ người lạ, điều này vô tình đưa anh đến gần hơn với ước mơ chung sống hòa bình giữa con người và Seraphim.