Được con người coi là kỳ lạ và sợ hãi, theo thời gian, những con dị hình đó được biết đến với cái tên Mushi. Mặc dù chúng không có ý định xấu đối với con người, nhưng nhiều người phải chịu những tác dụng phụ của sự tồn tại và bản chất kỳ lạ của chúng; Khai thác Mushi mà không hiểu họ, thậm chí là vô ý, có thể dẫn đến thảm họa và xung đột cho bất kỳ ai liên quan. Mushishi Zoku Shou tiếp tục câu chuyện về Mushishi Ginko trên hành trình giúp đỡ thế giới hữu hình để cùng tồn tại với Mushi.
Trong chuyến du hành của mình, Ginko phát hiện ra nhiều cá nhân tài năng khác nhau - những người bị hoàn cảnh nguyền rủa và những người duy trì mối quan hệ cộng sinh mong manh với Mushi - chắc chắn phải đối mặt với câu hỏi liệu nhân loại, tài năng và bị tra tấn giống nhau, có thể quản lý trách nhiệm của những người vô hình. Hơn nữa, là một Mushishi, Ginko phải tìm hiểu thêm về những sinh vật kỳ lạ này và quyết định xem mình có quyền can thiệp vào mối quan hệ phức tạp giữa Mushi và loài người hay không.