Nhà khoa học lập dị Rintarou Okabe luôn khát khao khám phá khoa học. Cùng với người bạn ngốc nghếch nhưng tốt bụng Mayuri Shiina và người bạn cùng phòng Itaru Hashida, Rintarou thành lập Phòng thí nghiệm Tiện ích Tương lai với hy vọng tạo ra những đổi mới công nghệ làm xáo trộn tâm lý con người. Bất chấp những tuyên bố về sự vĩ đại, "tiện ích" đáng chú ý duy nhất mà bộ ba đã tạo ra là một chiếc lò vi sóng có sức mạnh thần bí để biến chuối thành goo xanh.
Tuy nhiên, khi Rintarou quyết định tham dự hội nghị của nhà khoa học thần kinh Kurisu Makise về du hành thời gian, anh ta trải qua một loạt các sự kiện kỳ lạ khiến anh ta tin rằng có nhiều thứ ở tiện ích "Lò vi sóng điện thoại" hơn là gặp mắt. Dường như có thể gửi tin nhắn văn bản vào quá khứ bằng lò vi sóng, Rintarou đã tiếp cận sâu hơn với "cỗ máy thời gian", thu hút sự giận dữ và chú ý của tổ chức bí ẩn SERN.
Do khám phá mới lạ, Rintarou và những người bạn của anh ấy thấy mình đang gặp nguy hiểm thường trực. Khi anh ấy làm việc để giảm thiểu thiệt hại mà phát minh của anh ấy đã gây ra cho dòng thời gian, anh ấy không chỉ chiến đấu trong một trận chiến để cứu những người thân yêu của mình, mà còn chống lại sự tỉnh táo đang suy thoái của mình.